Baitul Arqom adalah salah satu kegiatan Muhammadiyah yang bisa dijadikan sebagai ajang penambah wawasan dan pengetahuan. Seperti yang telah dilakukan oleh SD Muhammadiyah Al Mujahidin Wonosari yang telah diikuti oleh seluruh guru dan karyawan. Kegiatan ini berlangsung selama 2 hari, yakni pada Kamis-Jumat, 18-19 April 2019 lalu. Selain bertujuan untuk meningkatkan wawasan dan pengetahuan tentang Muhammadiyah, kegiatan ini juga untuk menyiapkan diri menyambut bulan Ramadhan yang Insyaallah akan kita mulai pada 6 Mei 2019 nanti. Semua ini semata-mata guna meningkatkan kualitas ibadah kita kepada Allah SWT. 

Kegiatan Baitul Arqom dibuka pada Kamis siang dan dilanjutkan dengan menambah wawasan mengenai "Permasalahan-permasalahan dalam Fiqh Puasa", oleh narasumber dari Majelis Tarjih PDM Kab. Gunungkidul. Setelah Ashar, seluruh peserta mendapatkan motivasi melalui materi "Menegakkan Ideologi Guru Sekolah Muhammadiyah" oleh Ketua Dikdasmen PDM Kab. Gunungkidul. Tetap dengan semangat bermuhammadiyah, malam harinya diisi dengan tadarus dan materi "Kehidupan setelah Kematian" oleh Ustadz Eko Tuanto, S.Pd. "Program dan Target Ramadhanku" menjadi materi terakhir pada Jumat ba'da subuh, yang dipandu langsung oleh bapak Kepala Sekolah. Kegiatan ditutup dengan berolahraga dan sarapan bersama, yang dapat semakin menguatkan rasa kekeluargaan dan ukhuwah sesama warga SD Muh. Al Mujahidin.

Harapan dari kegiatan Baitul Arqom ini adalah terciptanya harmonisasi hubungan antara pimpinan, guru dan karyawan SD Muh. Al Mujahidin serta menyegarkan kembali niat awal guru dan karyawan dalam mengabdi dan berkarya di SD Muh. Al Mujahidin Wonosari.